对PDF文档的保护有以下方面，可以根据业务需求进行调整：

1. 对文档添加密码进行保护，对文档内容进行添加水印达到警示作用

2. 对文档内容进行密文处理，保证文档内容抹除，并不可回退

3. 通过数字证书对PDF进行DRM保护，并可配置文档的打印，批注等权限

4. 通过数字签名对PDF进行内容保护，防止用户意外或蓄意修改关键文件